La sezione di Preistoria e Protostoria del Museo Archeologico è attualmente chiusa al pubblico per lavori di riallestimento.

La collezione racconta, attraverso reperti in gran parte provenienti dalla Lombardia, le tappe fondamentali dell'evoluzione culturale e tecnologica dal Neolitico (VI-IV millennio a.C.) alla romanizzazione (fine III-Isecolo a.C.).

Strumenti in pietra scheggiata e levigata, ceramiche e attrezzi per la tessitura mostrano le grandi innovazioni del Neolitico. L'Età del Bronzo prende vita con asce, punte di lancia e corredi funerari, mentre l'Età del Ferro è rappresentata da preziosi reperti della cultura Golasecca, come la straordinaria Prima Tomba del Guerriero di Sesto Calende (fine VII secolo a.C.). Il percorso si conclude con i manufatti della cultura celtica (IV-I secolo a.C.), offrendo uno sguardo affascinante sulle radici della storia antica.